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海南白蟻防治中心為您普及:分子生物學(xué)技術(shù)在白蟻種類鑒定中的應(yīng)用研究東莞石碣白蟻防治中心為您普及:白蟻是一種世界性重要害蟲。全世界已知白蟻種類有約3000種[1],我國約400多種[2],在長江以南地區(qū)危害尤為嚴重。它們與人類經(jīng)濟密切相關(guān),可對人類社會造成較大危害[3-4]。早期傳統(tǒng)的形態(tài)分類法為白蟻的分類鑒定奠定了基礎(chǔ)。白蟻的外部形態(tài)相似,目前白蟻主要依靠兵蟻或有翅成蟲進行分類[5]。但是在區(qū)分一些相似種、近緣種上難度較大,容易引起誤判[6-7]。同時,白蟻的形態(tài)學(xué)分類往往需要一定數(shù)量的個體,分類時個體太少則會影響結(jié)果的可靠性,而有些白蟻種群的兵蟻很少,這都給白蟻的分類帶來了較大的困難。 基于聚合酶鏈式反應(yīng)( Polymerase chainreaction, PCR)技術(shù)為物種鑒定提供了新的手段,彌補了傳統(tǒng)形態(tài)鑒定的諸多不足[8]。該技術(shù)通過引物和模板DNA特異性的結(jié)合, 可在短時間內(nèi)擴增出數(shù)百萬特異DNA序列拷貝。它具有如下幾個優(yōu)點:(1)不受白蟻組織類別、發(fā)育階段等影響。DNA上得到的信息不會隨白蟻發(fā)育時期的不同而變化。(2)不受環(huán)境影響。因為環(huán)境只影響基因表達,而不改變基因的核苷酸序列。(3)DNA分子標記技術(shù)簡單、快速、易于自動化。(4)提取的DNA樣品,在低溫下可長期保存[9]。因此,近年來分子生物學(xué)技術(shù)被越來越廣泛地應(yīng)用于白蟻分類研究中。線粒體編碼細胞色素c氧化酶亞基Ⅱ基因(COⅡ)已成為當前動物分子系統(tǒng)中應(yīng)用最廣泛的分子標記[10]。Jenkins等首次利用COⅡ基因序列推斷臺灣乳白蟻入侵危害的途徑[11]。Miura等利用線粒體COⅡ基因和翻譯的蛋白質(zhì)序列對進化較高的白蟻科和鼻白蟻科15個屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進行了研究[12]。 本研究在廣東省范圍內(nèi)采集白蟻標本,并采用基于COⅡ基因部分序列的PCR產(chǎn)物直接測序法鑒別確認白蟻種類,該研究可為今后開展白蟻種群分布和危害調(diào)查提供科學(xué)基礎(chǔ),從而進一步掌握蟻害發(fā)生特點,提高白蟻防治水平。 2.材料和方法 2.1材料和儀器 2.1.1材料和試劑 一次性組織研磨棒、1.5mL離心管、200μL PCR薄壁管,1000μL、200μL、10μL槍頭、上下游引物均購;Takara r-taq 酶(250U)、Takara DL 2000 DNA marker(500μL)購;EasyPure Genomic DNA提取試劑盒、Axygen膠回收試劑盒、Biowest Agarose瓊脂糖(100g)。 2.1.2儀器設(shè)備 梯度PCR儀、瓊脂糖水平電泳儀、手提紫外分析儀、Fresco 21微型離心機、凝膠成像系統(tǒng)、電子分析天平(0.0001g)、全自動蒸汽高壓滅菌鍋、移液槍、超級恒溫水浴鍋。 2.2試驗方法 2.2.1白蟻樣本采集 從全廣東省范圍內(nèi),特別是白蟻危害重點區(qū)域采集白蟻標本。采集白蟻時,取活體或死亡時間少于24 h的完整成蟲體,密封保存于99.9%酒精的樣本瓶中,做好標簽和記錄。 2.2.2白蟻組織基因組DNA提取 選取白蟻整體為試驗材料,用紙巾將樣品表面的酒精和水分吸干后,稱重,控制樣品質(zhì)量≤25 mg。樣品用研磨棒研磨,采用EasyPure Genomic DNA提取試劑盒提取樣品基因組DNA。最后用EB溶液進行兩次洗脫,合并兩次的洗脫液用于PCR反應(yīng)的模板。 2.2.3 PCR擴增COⅡ基因部分序列 2.2.3.1引物 通常用于種群分類分析的基因是16S rRNA、COI、COII、ND1、ND5[2]。本文采用以下引物用于片段擴增:上游引物COⅡ1:5’-CAGATAAGTGCATTGGATTT-3’;下游引物COⅡ2:5’-GTTTAAGAGACCAGTACTTG-3’。 2.2.3.2擴增體系 采用Takara公司生產(chǎn)的PCR試劑盒。反應(yīng)體系50μL,包括:5μL10×buffer(Mg2+-),4μLdNTP,3μLMg2+,正反引物各1μL(20 mmol/L),1μLDNA模板,17μL滅菌超純水。 PCR反應(yīng)條件如下:起始94℃預(yù)變性3min,然后94℃變性30s,50℃退火1 min,72℃延伸1 min,30個循環(huán)。最后72℃反應(yīng)10 min。PCR產(chǎn)物用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測,并用EB染色。用DNA marker(DL2000)標記擴增片段大小,以確定是否為目的片段。電泳后置于凝膠成像系統(tǒng)觀察。 對于有雜質(zhì),需要純化的PCR產(chǎn)物,采用Axygen膠回收試劑盒純化后測序;對于擴增效果良好的PCR產(chǎn)物則可直接測序。本實驗廣東生物資源應(yīng)用研究所進行測序和拼接,每個樣品采用正反鏈雙向測序,以提高測序的準確度。 2.2.4數(shù)據(jù)分析 根據(jù)委托公司發(fā)回的測序結(jié)果,將正反鏈拼接得出的堿基序列在NCBI網(wǎng)站(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)上進行BLAST相似性搜索,選擇相似度最高的確定為該物種。 3.結(jié)果與分析 3.1白蟻標本采集結(jié)果 在廣東省范圍內(nèi),特別是白蟻危害重點區(qū)域共收集有效白蟻標本185個。 3.2 PCR擴增結(jié)果 以編號zj144、zj035、zj115、zj102、zj101、zj100、zj099、zj097、zj095、zj094、 zj093、zj092的樣品為例,PCR擴增結(jié)果見圖1。引物對檢測樣本擴增出800bp左右的條帶。結(jié)果顯示,檢測樣本的PCR擴增結(jié)果與設(shè)計目標相同;同時,目標條帶明亮清晰,說明PCR擴增特異性較高,效果良好,PCR產(chǎn)物可直接測序。 圖1引物PCR擴增圖(從左到右條帶分別為DNA marker(DL2000)、zj144、zj035、zj115、 zj102、zj101、 zj100、 zj099、zj097、zj095、zj094、 zj093、 zj092) 3.3 測序結(jié)果 以編號zj004的白蟻標本為例,測序后拼接得出的堿基序列如圖2所示。將堿基序列在NCBI網(wǎng)站上進行BLAST相似性搜索,結(jié)果見圖3。結(jié)果顯示,zj004號樣本與臺灣乳白蟻這一物種的基因相似度最高,相似度達99%。同時結(jié)合形態(tài)學(xué)特征,確認zj004號樣本為臺灣乳白蟻。 圖2 zj004號白蟻樣本拼接堿基序列 4.總結(jié)與展望 本研究在廣東省范圍內(nèi)采集白蟻標本185份,經(jīng)分子生物學(xué)方法共鑒定出2科4屬7種白蟻。散白蟻所占比例明顯高于其他屬白蟻,其中黑胸散白蟻比例最高,為該地區(qū)優(yōu)勢蟻種。 隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,利用分子生物學(xué)技術(shù)進行種類鑒別、檢測的應(yīng)用越來越多[13-14]。本文利用分子生物學(xué)技術(shù)對白蟻種類做出鑒別,無論白蟻何種生物型和蟲態(tài),均可用于鑒定;同時需要的樣品量少,簡便快捷,提取的DNA模板可用于多次檢測。但需要注意的是,要防止昆蟲標本DNA降解,才能獲得可靠準確的遺傳信息。相信隨著研究的不斷深入,實驗技術(shù)將不斷完善和提高。在結(jié)合形態(tài)學(xué)鑒定的基礎(chǔ)上,現(xiàn)代分子生物技術(shù)正成為白蟻分類鑒定的有力手段,為進一步開展白蟻的分布和危害調(diào)查提供更為堅實的科學(xué)基礎(chǔ),并為白蟻防治提供新的方法和思路。 東莞市波記白蟻防治服務(wù)部是一家專業(yè)從事東莞白蟻防治,萬江白蟻防治,高埗白蟻防治,東城白蟻防治,南城白蟻防治,望牛墩白蟻防治,石碣白蟻防治,中堂白蟻防治,道滘白蟻防治,麻涌白蟻防治,大嶺山白蟻防治,石龍白蟻防治,新城白蟻防治業(yè)務(wù)的專業(yè)消殺公司 |